# Day 1 Linux基本命令 ### ⚠️ 小提示：脚本中的相对路径 如果你在脚本中用的是相对路径（比如 `./data/input.txt`），那么脚本运行时的“当前工作目录”就会影响它的行为。 为避免出错，可以在脚本开头加一句让路径自动转为脚本自身所在目录： ```bash bash 复制编辑 DIR="$(cd "$(dirname "$0")" && pwd)" ``` 然后用 `${DIR}/data/input.txt` 来引用脚本目录下的文件。 ### 在 **终端命令行（如 bash/zsh）**： - **`Ctrl + U`**：删除光标前的所有字符 - **`Ctrl + K`**：删除光标后的所有字符 - **`Ctrl + A`**：移动到行首（可搭配 Ctrl+K） - **`Ctrl + E`**：移动到行尾 ### 示例：一键删除整行 ```bash Ctrl + A → Ctrl + K ``` ### 🧭 文件/目录查看与导航 | 命令 | 全称 | 作用 | 常见用法 | | --- | --- | --- | --- | | `ls` | **list** | 列出目录内容 | `ls -l` 查看详细信息`ls -a` 显示隐藏文件 | | `cd` | **change directory** | 切换当前工作目录 | `cd /path/to/dircd ..` 返回上一级 | | pwd | print work directory | 打印当前工作目录 | | --- ### 🔁 文件与目录操作 | 命令 | 全称 | 作用 | 常见用法 | | --- | --- | --- | --- | | `mv` | **move** | 移动或重命名文件/目录 | `mv a.txt b.txt` 重命名`mv a.txt dir/` 移动 | | `cp` | **copy** | 复制文件或目录 | `cp a.txt b.txtcp -r dir1 dir2` 递归复制目录 | | `rm` | **remove** | 删除文件或目录 | `rm a.txt` 删除文件`rm -rf dir/` 强制删除目录 | | `mkdir` | **make directory** | 创建目录 | `mkdir newdirmkdir -p a/b/c` 创建多级目录 | | `rename` | **rename**（并非 GNU 标准一部分） | 批量重命名文件（需安装） | `rename 's/.txt/.bak/' *.txt` | --- ### 📄 文件查看与编辑 | 命令 | 全称 | 作用 | 常见用法 | | --- | --- | --- | --- | | `cat` | **concatenate** | 查看、连接文件内容 | `cat file.txt` 查看文件`cat a b > c` 合并 | | `nano` | **Nano text editor** | 命令行文本编辑器 | `nano file.txt` 编辑文件 | | `touch` | **touch file timestamp** | 创建空文件或更新修改时间 | `touch new.txt` 创建新文件或刷新时间戳 | --- ### 📝 示例场景 ```bash bash 复制编辑 mkdir projects # 创建目录 cd projects # 进入目录 touch README.md # 创建文件 nano README.md # 编辑文件 ls -l # 查看当前目录内容 cp README.md copy.md # 复制文件 mv copy.md docs.md # 重命名文件 rm docs.md # 删除文件 ``` - - `ls` 查看当前目录下的文件和目录 ```bash ls # 简单列出 ls -l # 详细信息（权限、大小、修改时间） ls -a # 显示隐藏文件 ``` - `cd` 切换目录 ```bash cd /path/to/directory cd .. # 返回上一级目录#cd后有一个空格 cd ~ # 回到当前用户主目录 ``` --- ### 🔁 文件/目录操作 - `cp` 复制文件或目录 ```bash cp file1.txt file2.txt # 复制文件 cp file1.txt /path/to/destination/ # 复制到指定目录 cp -r dir1/ dir2/ # 递归复制目录 ``` - `mv` 移动或重命名文件/目录 ```bash mv file.txt /path/to/destination/ # 移动 mv oldname.txt newname.txt # 重命名 ``` - `rm` 删除文件或目录 ```bash rm file.txt # 删除文件 rm -r folder/ # 递归删除目录 rm -rf folder/ # 强制删除，不提示 ``` - `rename` 批量重命名文件（需安装 `rename` 工具） ```bash rename 's/.txt/.bak/' *.txt # 将所有 .txt 文件扩展名改为 .bak ``` --- ### 🛠️ 文件内容处理与编辑 - `cat` 查看文件内容（或合并文件） ```bash cat file.txt cat file1.txt file2.txt > merged.txt ``` - `nano` 终端内简单文本编辑器 ```bash nano file.txt ``` - `touch` 创建空文件，或更新已有文件的时间戳 ```bash touch newfile.txt ``` ### 📁 `mkdir` – 创建目录（文件夹） `mkdir`（**make directory**）用于在 Linux 中创建一个或多个新目录。 ### ✅ 基本用法： ```bash mkdir my_folder # 创建一个名为 my_folder 的新目录 ``` ## *通配符的作用 - 匹配 **0个或多个任意字符** - 常用于匹配文件名、路径名、样本名等 --- ### ✅ 举例说明： ### 📁 假设当前目录下有这些文件： ``` sample1_R1.fastq.gz sample1_R2.fastq.gz sample2_R1.fastq.gz sample2_R2.fastq.gz notes.txt ``` ### 示例 1：匹配所有 `.fastq.gz` 文件 ```bash ls *.fastq.gz ``` ➡️ 输出： ``` sample1_R1.fastq.gz sample1_R2.fastq.gz sample2_R1.fastq.gz sample2_R2.fastq.gz ```