Day 1 Linux基本命令

⚠️ 小提示：脚本中的相对路径

如果你在脚本中用的是相对路径（比如 ./data/input.txt），那么脚本运行时的“当前工作目录”就会影响它的行为。

为避免出错，可以在脚本开头加一句让路径自动转为脚本自身所在目录：

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bash
复制编辑
DIR="$(cd "$(dirname "$0")" && pwd)"

然后用 ${DIR}/data/input.txt 来引用脚本目录下的文件。

在 终端命令行（如 bash/zsh）：

• Ctrl + U：删除光标前的所有字符
• Ctrl + K：删除光标后的所有字符
• Ctrl + A：移动到行首（可搭配 Ctrl+K）
• Ctrl + E：移动到行尾

示例：一键删除整行

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Ctrl + A → Ctrl + K

🧭 文件/目录查看与导航

🔁 文件与目录操作

📄 文件查看与编辑

📝 示例场景

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bash
复制编辑
mkdir projects              # 创建目录
cd projects                 # 进入目录
touch README.md             # 创建文件
nano README.md              # 编辑文件
ls -l                       # 查看当前目录内容
cp README.md copy.md        # 复制文件
mv copy.md docs.md          # 重命名文件
rm docs.md                  # 删除文件

• ls

  查看当前目录下的文件和目录

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  ls # 简单列出 ls -l # 详细信息（权限、大小、修改时间） ls -a # 显示隐藏文件

• cd

  切换目录

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  cd /path/to/directory cd .. # 返回上一级目录#cd后有一个空格 cd ~ # 回到当前用户主目录

🔁 文件/目录操作

• cp

  复制文件或目录

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  cp file1.txt file2.txt # 复制文件 cp file1.txt /path/to/destination/ # 复制到指定目录 cp -r dir1/ dir2/ # 递归复制目录

• mv

  移动或重命名文件/目录

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  mv file.txt /path/to/destination/ # 移动 mv oldname.txt newname.txt # 重命名

• rm

  删除文件或目录

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  rm file.txt # 删除文件 rm -r folder/ # 递归删除目录 rm -rf folder/ # 强制删除，不提示

• rename

  批量重命名文件（需安装 rename 工具）

  1 2	rename 's/.txt/.bak/' *.txt # 将所有 .txt 文件扩展名改为 .bak

🛠️ 文件内容处理与编辑

• cat

  查看文件内容（或合并文件）

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  cat file.txt cat file1.txt file2.txt > merged.txt

• nano

  终端内简单文本编辑器

  1 2	nano file.txt

• touch

  创建空文件，或更新已有文件的时间戳

  1 2	touch newfile.txt

📁 mkdir – 创建目录（文件夹）

mkdir（make directory）用于在 Linux 中创建一个或多个新目录。

✅ 基本用法：

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mkdir my_folder         # 创建一个名为 my_folder 的新目录

*通配符的作用

• 匹配 0个或多个任意字符
• 常用于匹配文件名、路径名、样本名等

✅ 举例说明：

📁 假设当前目录下有这些文件：

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sample1_R1.fastq.gz
sample1_R2.fastq.gz
sample2_R1.fastq.gz
sample2_R2.fastq.gz
notes.txt

示例 1：匹配所有 .fastq.gz 文件

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ls *.fastq.gz

➡️ 输出：

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sample1_R1.fastq.gz
sample1_R2.fastq.gz
sample2_R1.fastq.gz
sample2_R2.fastq.gz